达瑞服务
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DARUI SERVICE
科研服务
Scientific research and service
微生物研究
Microbiology research
达瑞病原微生物检测平台将基于多个平台打造感染项目的全覆盖检测服务品牌,从快速培养,到血清学检测和核酸检测,从一代测序,二代测序到三代测序,从低通量的QPCR、核酸质谱到高通量测序,多种组合供临床选择,为感染项目保驾护航,主要从以下几个方面研发:首先三代测序作为基因测序的POCT,打造床边检测服务,广谱检测不遗漏微生物,结合二代测序基于宏基因组、宏转录组和单菌基因组流程,为疾病寻根问底提供更好的依据;然后是核酸质谱平台微生物检测流程改良,对于不同科室的小Panel可供临床选择,为多样化服务提供更好的对接;以及快速培养为微生物单菌检测提供更好的阳性方案,培养作为金标准,快速找到对应的微生物,对于临床判定增加更好的依据。
微生物研究
第二代测序技术
以Roche公司的454技术、Illumina公司的Solexa技术和ABI公司的Solid技术为标志的第二代测序技术被称为下一代测序技术(next generation sequencing,NGS)在极大降低了测序成本的同时,还大幅提高了测序速度,并且保持了高准确性,在病原微生物的快速检测、溯源及传染病性疾病防控等公共卫生方面发挥越来越大的作用。
454技术的发明人之一Jonathan Rothberg还发明了一种基于半导体芯片的测序技术-Ion Torrent。该项技术仅在信号检测方面与454技术有所不同,在测序过程中不是通过检测焦磷酸荧光显色,而是通过检测H+信号的变化来获得序列碱基信息。该技术使用了一种布满小孔的高密度半导体芯片,可以检测反应池中的pH值的变化。当离子感受器感受到H+信号,H+信号再转化为数字信号,从而读出DNA序列。Ion Torrent相比于其他测序技术来说,不需要昂贵的成像设备,因此,设备成本较低,测序速度快,整个上机测序可在2~3.5 h内完成,ABI公司基于Ion torrent 平台推出的Ion Proton与S5测序平台,通量15Gb的通量,运行时间7h,对应的病原微生物二代测序试剂盒和分析解读软件,实现了临床检测的高度自动化和标准化。
第三代测序技术
以Oxford Nanopore Technologies的纳米孔单分子测序技术和PacBio公司的单分子实时测序技术,被称之为第三代测序技术,其最大的特点是实现了对一个DNA分子的序列测定,也就是说在测序过程无需进行PCR反应来对模板分子进行扩增以扩大检测信号的强度,这就避免了PCR过程中所引入的偏差(Bias)和错误(Error),实现了对特殊序列的DNA片段的测序。纳米孔(nanopore)测序技术是近年来发展的最具应用潜力的测序技术,纳米孔的直径非常细小,仅允许单个核酸聚合物通过,因而可以在此基础上使用多种方法来进行高通量检测。

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